菌種鑒定

菌種鑒定有多種方法,而通過(guò)DNA測序鑒定的方法被譽(yù)為金標準。DNA 測序進(jìn)行菌種鑒定的結果比傳統生化鑒定更為直接,鑒定結果也更為可靠。
核糖體RNA(rRNA)是生物細胞中主要的核糖核酸之一。rRNA分子的一級結構既具有高度保守性區域,又具有高度變化特異性區域。保守區域反映了生物物種間的親緣關(guān)系,可用于構建生命統一進(jìn)化樹(shù),而高度變化特異區域則能表明物種間的差異,可用于區別屬或種。

服務(wù)內容

1. 16S rRNA

16S rRNA位于原核細胞核糖體小亞基上,是細菌分類(lèi)學(xué)研究中常用的”分子鐘”,其序列包含10個(gè)保守區域和9個(gè)高度變化特異性。其中保守區在細菌間差異不大,高度變化性特異性區域具有屬或種的特異性,序列則隨菌間的親緣關(guān)系不同而有一定的差異。因此,16S rRNA基因是能揭示生物物種的特征核酸序列,被認為是適用于細菌系統發(fā)育和分類(lèi)鑒定的指標。

16S rDNA基因測序,通常是選擇某個(gè)或某幾個(gè)變異區域,選擇通用引物進(jìn)行擴增成PCR產(chǎn)物,然后進(jìn)行測序分析和菌種鑒定。通過(guò)檢測16S rDNA的序列變異和豐度,可以了解環(huán)境樣品中群落多樣性信息?;?6S rDNA的分析在微生物分類(lèi)鑒定,微生態(tài)研究等方面起到重要作用。

2. 18S rDNA或ITS(Internal Transcribed Spacer)

18S rDNA和ITS被廣泛應用在真菌分類(lèi)鑒定中。18S rDNA在系統發(fā)育研究中較適用于種級以上階元的分類(lèi)。ITS屬于中度保守的區域,利用它可研究種及種以下的分類(lèi)階元。

服務(wù)優(yōu)勢

  1. 結果準確可靠:嚴格控制交叉污染,測序信號準確可靠。
  2. 經(jīng)驗豐富:多種引物組合結合強大的基因組提取和PCR擴增能力,具有豐富的經(jīng)驗可以解決擴增或測序失敗等難題。

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